雅典耀大学始建于1859年10月1日，是一所由基督教的西班牙牧师们建立的，以西班牙后裔为对象的私立小学。
1912年，美国耶稣会接管了雅典耀。
1965年，新增加一个科系ART（人文科系），后更名为“Ateneo Municipal de Manila”，有教授音乐及艺术等，增加一些专业技术之课程，例如农业、商业等。
19世纪初，美国政权给Ateneo带来了一些改变。
1921年，美国纽约之耶稣教会取代了西班牙耶稣教会在Ateneo的主导权。
1932年，校址迁移至Padre Faura. Ermita。1952年，由于海外基金之援助，Ateneo迁移至现今的校园（Loyola Heights. Quezon City）。
1959年，获得颁发大学学位资格，而今大学不断扩大为包括文科学学院、商学研究所、法学院等多个独立学院在内的综合型大学。除此之外，就如大部分的菲律宾大学一样，拥有高中及小学。菲律宾现任总统格洛丽亚 马卡帕加尔 阿罗约曾经就读该校，并在从政前担任过该校的助理教授。
雅典耀大学是菲律宾四大名校之一。与美国众多高校保持长年的学术交流，在海外享有盛誉。Ateneo的中文翻译名称众多，如阿特尼奥、阿托雷欧、安德雷尔等。雅典耀是华人或讲华语的传教士普遍使用的名称。
蓝鹰是雅典耀大学的象征，它预示着每个毕业的学生在未来的领域里如蓝鹰一样翱翔。
本科生专业
生物学/生命科学/化学/化学和计算机应用系统学/化学和材料科学与工程理学士/.应用化学管理理学士/化学/电子与通信工程学/计算机工程学/环境科学/健康科学理学/计算机科学/管理信息系统学/数学/应用数学理学士（主修金融数学）/物理学/应用物理与应用计算机系统学/应用物理与材料科学和工程学/应用物理管理学/管理学/（主修通信技术管理，法制化管理/管理工程学/中国研究文科学士通讯学士/发展研究学士/经济学学士/经济学荣誉学士/管理经济学学士/欧洲研究学士/历史学学士/政治学学学士/政治学学本硕连读（主修全球政治）/公共管理学士/心理学学士/心理学学士*/社会科学学士/美术学士（主修艺术管理学士）/美术学士主修艺术管理学士/艺术学士（主修人文学学士）/艺术学士主修跨学科研究学士（主修哲学）/
研究生课程
生物教育学硕士/生物学硕士/生物学理学硕士/化学硕士/化学教育理硕士/化学理硕士/电子工程理硕士/环境科学理硕士/环境管理理硕士/计算机科学理硕士/信息技术理硕士/数学硕士/数学教育理硕士/物理学硕士/文学硕士/文学硕士（主修教学理念）/工商管理硕士/工商管理硕士（针对中层管理人员课程）/雅典耀 - 瑞吉斯工商管理硕士/工商管理硕士（主修健康）/创业学硕士（ME）项目/法律硕士/
博士课程
计算机科学博士/化学博士/数学博士/医学博士
学期安排
第一学期6月-9月
第二学期10月-1月
暑 修2月-5月
入学条件
大学部高中（中专，职中）以上学历
硕士本科起点
博士硕士起点